Эрдэм шинжилгээний номын сан нь түүх, археологи, угсаатан зүй, монгол судлал, хэл шинжлэл, музей судлалын чиглэлээр төрөлжсөн 7000 ширхэг номын цуглуулгатай бөгөөд Дьюигийн аравтын ангиллаар ангилсан, цахим каталогтой, олон улсын стандарт хайлтын “МонКоха” системтэй холбогдож номын мэдээллүүдийг хайлтын системд оруулаад байна. Эрдэм шинжилгээний номын сан нь эрдэмтэн судлаачдад эрдэм шинжилгээ, судалгааны ажил явуулахад тав тухтай орчин бүхий 160.7 м2 талбайтай 8 хүн сууж үйлчлүүлэх уншлагын танхимтай, 209.6 м2 талбайтай номын фонд, 2 номын санчтайгаар үйл ажиллагаа явуулдаг.